應(yīng)該怎樣尋找基因啟動(dòng)子區(qū)呢?？
u_110543517
2021-08-26 06:27
這個(gè)主要是通過(guò)計(jì)算機(jī)方法，有幾種選擇。作為一個(gè)規(guī)則，通過(guò)多種方法預(yù)測(cè)的外顯子提高了預(yù)測(cè)的正確率而不會(huì)出現(xiàn)“假陽(yáng)性”結(jié)果。多數(shù)方法顯示3′端非翻譯區(qū)，以左側(cè)大而短的塊狀表示。Acembly路徑顯示除了全長(zhǎng)序列產(chǎn)物（如這個(gè)部分第3條線所示）之外還有3個(gè)可能的選擇性剪接，其它大多數(shù)路徑顯示與此預(yù)測(cè)結(jié)果相符。Genscan路徑從左、右方向往遠(yuǎn)處延伸：GENSCAN可以被用于預(yù)測(cè)多個(gè)基因。推薦一篇文章：http://wenku.baidu.com/view/78 ... .html
ty_135074791 2021-08-26 06:33
?啟動(dòng)子是基因（gene）的一個(gè)組成部分，控制基因表達(dá)（轉(zhuǎn)錄）的起始時(shí)間和表達(dá)的程度。 基因啟動(dòng)子位于基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)的上游幾kb的區(qū)域內(nèi)，一般來(lái)說(shuō)啟動(dòng)子區(qū)域具有一定的保守序列特征，另外，啟動(dòng)子區(qū)域一般還具有比較高比例的GC含量，這些高GC含量的區(qū)域組成一些GC島；如果一個(gè)新的基因在不能確定其啟動(dòng)子的情況下，最好在設(shè)計(jì)PCR引物時(shí)，多設(shè)計(jì)幾對(duì)，最大限度地將新基因的啟動(dòng)子區(qū)域囊括在這些PCR里面。
涼涼愛(ài)家喂 2021-08-26 06:35
啟動(dòng)子是參與特定基因轉(zhuǎn)錄及其調(diào)控的DNA序列。包含核心啟動(dòng)子區(qū)域和調(diào)控區(qū)域。核心啟動(dòng)子區(qū)域產(chǎn)生基礎(chǔ)水平的轉(zhuǎn)錄，調(diào)控區(qū)域能夠?qū)Σ煌沫h(huán)境條件作出應(yīng)答，對(duì)基因的表達(dá)水平做出相應(yīng)的調(diào)節(jié)。
對(duì)于如何查找啟動(dòng)子，現(xiàn)在又很多軟件可以應(yīng)用，而且ncbi上也可以應(yīng)用，所以是比較方便的。
國(guó)民男神林更新 2021-08-26 06:44
一般來(lái)說(shuō)從數(shù)據(jù)庫(kù)找。像是NCBI之類(lèi)的，網(wǎng)上有教程的，像是http://wenku.baidu.com/link%3F ... KZYEe
這個(gè)主要是通過(guò)計(jì)算機(jī)方法，有幾種選擇。作為一個(gè)規(guī)則，通過(guò)多種方法預(yù)測(cè)的外顯子提高了預(yù)測(cè)的正確率而不會(huì)出現(xiàn)“假陽(yáng)性”結(jié)果。多數(shù)方法顯示3′端非翻譯區(qū)，以左側(cè)大而短的塊狀表示。Acembly路徑顯示除了全長(zhǎng)序列產(chǎn)物（如這個(gè)部分第3條線所示）之外還有3個(gè)可能的選擇性剪接，其它大多數(shù)路徑顯示與此預(yù)測(cè)結(jié)果相符。Genscan路徑從左、右方向往遠(yuǎn)處延伸：GENSCAN可以被用于預(yù)測(cè)多個(gè)基因。推薦一篇文章：http://wenku.baidu.com/view/78 ... .html
ty_135074791 2021-08-26 06:33
?啟動(dòng)子是基因（gene）的一個(gè)組成部分，控制基因表達(dá)（轉(zhuǎn)錄）的起始時(shí)間和表達(dá)的程度。 基因啟動(dòng)子位于基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)的上游幾kb的區(qū)域內(nèi)，一般來(lái)說(shuō)啟動(dòng)子區(qū)域具有一定的保守序列特征，另外，啟動(dòng)子區(qū)域一般還具有比較高比例的GC含量，這些高GC含量的區(qū)域組成一些GC島；如果一個(gè)新的基因在不能確定其啟動(dòng)子的情況下，最好在設(shè)計(jì)PCR引物時(shí)，多設(shè)計(jì)幾對(duì)，最大限度地將新基因的啟動(dòng)子區(qū)域囊括在這些PCR里面。
涼涼愛(ài)家喂 2021-08-26 06:35
啟動(dòng)子是參與特定基因轉(zhuǎn)錄及其調(diào)控的DNA序列。包含核心啟動(dòng)子區(qū)域和調(diào)控區(qū)域。核心啟動(dòng)子區(qū)域產(chǎn)生基礎(chǔ)水平的轉(zhuǎn)錄，調(diào)控區(qū)域能夠?qū)Σ煌沫h(huán)境條件作出應(yīng)答，對(duì)基因的表達(dá)水平做出相應(yīng)的調(diào)節(jié)。
對(duì)于如何查找啟動(dòng)子，現(xiàn)在又很多軟件可以應(yīng)用，而且ncbi上也可以應(yīng)用，所以是比較方便的。
國(guó)民男神林更新 2021-08-26 06:44
一般來(lái)說(shuō)從數(shù)據(jù)庫(kù)找。像是NCBI之類(lèi)的，網(wǎng)上有教程的，像是http://wenku.baidu.com/link%3F ... KZYEe
